许多风险管理者只关注直接交易成本，忽略了间接成本，导致对冲计划的成本远远超过了其收益。因此了解间接成本的类型也是进行对冲操作的必修课。
持有保证金的机会成本和损失的有利机会是值得讨论的两种间接成本类型。持有保证金的机会成本是指当企业实施对冲安排时，在资产负债表上持有的防范未来可能债务的额外资金。这份额外资金是容易被忽视的机会成本。损失的有利机会是指对冲计划实行时锁定的价格后来出现有利变化，从而造成有利机会收益的流失。损失的有利机会的间接成本取决于对商品价格下限和上限的预测。
除了了解成本以后，对冲操作的风险选择也应当引起重视。企业应该只对构成实质性影响，或威胁其战略计划的风险进行对冲。然而一些企业或单独的业务单元采用的对冲计划，很少或完全没有为股东创造价值。例如，一家综合性铝业公司坚持对其使用天然气的风险进行对冲却并未对其生产的铝进行风险对冲，该公司盈利波动幅度的75%以上都是由铝价推动的，受天然气影响很小。企业各业务单元为保护自己的业绩选择一些相关风险进行对冲操作的现象很普遍，可能这些风险对企业整体而言却无关紧要。这就是不明智的对冲计划。判断某种特定风险是否具有实质威胁，重点是了解一家企业的现金流能否满足其现金需求。