古代埃及人除了上述历法外，同时也根据月缺月圆的变化规律制定了阴历。一年分为12个月，354.36天，比太阳历少10.89天。因此每3年需加上1个月。这种历法主要用于确定宗教节日。
三、医学
古代埃及的医学在古代世界享有盛誉，被认为是当时最好的医学。希罗多德介绍说，埃及医学技术分为各种专门，“每一个医生只治一种病，不治更多种的病。国内的医生是非常多的，有治眼的、有治头的、有治牙的、有治肚子的，还有的治各种隐疾的”[33]。从流传下来的医学纸草文献来看，古代埃及人对基础医学和临床医学知识都已有了比较多的了解。
制作木乃伊的风俗使古代埃及人在解剖学上有突出的发展。他们熟知人体和一些哺乳动物的各种器官的形状、位置，并对某些器官的功能有一定的了解。例如，《埃伯尔斯纸草》里有一段文字论述人的心血管：“医生秘诀的根本，就是心脏运动的知识，脉管从心脏通过人体各部，因为任何医生，任何索赫美特女神的祭司，任何魔法师在触到头、后脑、手臂、手掌、脚的时候，到处都会触到心脏。因为脉管是从心脏分向人体的每一部分的。”古代埃及人认为心脏是各路脉管的中心，他们看到了脉搏与心脏跳动的直接联系，但对血液和血液循环从未提及。他们把心脏看作人体最重要的器官，是人的生命和才智之源，因此制作木乃伊时心脏不可移出体外。